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Tipos de plásmidos
Virulencia y resistencia
Gpos de imcompatibilidad
Conjugación y no conjugativos
Adquisición ADN plasmático
Fertilidad
Bacterias que giran positivo
Archea hipertermofilus
Methanococcus fervidus
Que es una mella
Lugar donde se traslapa el ADN bacteriano. Esto aporta resistencia a la desnaturalización
Bacterias que pueden degradar antibioticos
Salmonella typhi
Neisseria Meningitidis
Neisseria Gonorrhoae
Mutación con sentido erróneo
Cambio de un par de bases se da la sustitución de un Aa. en la proteína
Mutación sin sentido
Codon de terminación prematuro. Se da en ARN
Mutaciones en RNA
Principalmente en virus
100x mayor que en ADN
No existen métodos de reparación de ARN
Mutágenos químicos
Análogos a bases
Alquilantes
Intercambiables
Mutagenos Análogos a bases
Se unen a bases N pero no exhiben correctas propiedades de plegamiento
mutagenos Alquilante
Ataca el ADN cuando no se está replicando. Inducen mutaciones con mayor frecuencia
Transformación
ADN donador se encuentra en estado libre en ambiente
Transducción
Transferencia de ADN mediada por un virus
Conjugación
Implica contacto célula-célula, presencia de plásmido conjugativo de la célula donadora
Que es que una célula sea competente para intercambio genético
Que sea capaz de tomar ADN y ser transformada.
Es determinada genéticamente y regulada.
Proteínas específicas (Autolisina y nucleasas)
Transformación génica
ADN se incormpora a la célula y lleva a cambio un cabo genético, se da a cabo por recombinación o entrecruzamiento
Características para que se de la tranformación génica
Pared celular intacta
ADN donador debe ser doble cadena
Basta la interacción de una sola molécula de ADN con la receptora
ADN entrante debe recombinarse para transmitir características
Célula debe ser competente
Incorporación en transformación génica
ADN entra monocaternario
Gram -: ADN se degrada en el periplasma y penetra el cito en forma de cadena sencilla
Gram +: Sólo toman un lado de la cadena mientras degradan el otro simultáneamente
Integración en transformación génica
ADN se asocia con proteína específica para no ser degradada hasta que es sustituida por RecA
Se integra por recombinación
Quarum Sensing
Sistema de comunicación que conforman una matriz que les confiere mayor resistencia por biopelículas.
Que es una biopelícula.
Comunidades microbianas con gran capacidad de adherencia a una superficie donde se produce una matriz de exopolisacáridos
Biopelículas usadas en procesos de biorremediación y tratamiento de aguas residuales
Agrobacterium tumefacien
Erwina carotovora
Pantoea stweartii
Ralstonia solanacearum
Pseudomonas aureofaciens
caracterísitcas transducción génica
Gen bacteriano transferido por virus
Es error en empaquetamiento del genoma viral
Ciclo lítico
Fijación
Inyección material genético
Degrada el cromosoma bacteriano
Replicación genoma vírico
Sintetizar cuerpos víricos proteícos
Empaquetación de ADN en cuerpo vírico
Lisis de la bacteria, liberación de bacteriofágos
Ciclo lisogénico
Fijación a pared
Inyección del material
Recmbina ADN con el ADN del cromosoma bacteriano
Replica el ADN junto con el bacetriano cuando hace mitosis
ADN vírico se escinde del cromosoma
Se lleva a cabo ciclo lítico
Transducción generalizada
Debido a error se empaqueta una porción de ADN bacteriano en cuerpo vírico en lugar de el del bacteriofago
No hay especificidad
Se puede integrar (transferencia completa) Degradar (se lisa) o sobrevivir (nomás está ahí alv)
Transducción específica
El ADN bacteriano cerca de la zona de integración es el que se va durante la escisión con el viral
Conversión fágica
Bacteriofago lisogeniza una célula es unmune a una nueva infección por el mismo tipo.
Corynobacteruim diphteriae no produce toxinas en cepas productoras de toxinas
Conjugación.
Mecanismo de transferencia genética que implica contacto entre células.
Mediado por plásmido, (Célula que lo tiene y célula receptora que no lo tiene)
Descubierto por plásmido F de E. coli
Plásmido F
F de fertilidad, Kapon.
Región del plásmido contiene genes que regulan la replicación del ADN. Elementos transponibles permiten al plásmido integrarse en el cromosoma del hospedador.
Región tra contieen genes que codifican las funciones de transferencia.
Plásmido F: El imperio contraataca
Origen de replicación: Ori
Sitio de inicio: OriT
Sólo células con este plásmido producen pilis.
Congujación de Gram - depende del apareamiento de las células a través de los pelos (a lo avatar we)
Mecanismo de transferencia del ADN: Circulo rodante (olv)
ADN del plásmido F se replica por circulo rodante (usado también por virus)-
1: Contacto desencadena la transferencia de ADN. En el momento que una cadena del ADN circular es cortada y transferida al receptor.
Enzima que corta en Transferencia del circulo rodante
TraI, que también la desenrrolla
Circulo rodante parte 2
A medida que se prodduce la transferencia, el mecanismo reemplaza la cadena transferida en el donador mientras se sintetiza una cadena complementaria.
Al final los dos tienen el plásmido completo
Se tarda 5 min (100 kbp)
Cómo se pueden perder los plásmidos en transferencia de circulo rodante
Por curación, no hay presión selectiva para mantener el plásmido
Que es un episoma
Plásmido que se puede integrar en el cromosoma del hospedador. Ya integrado, pueden transferir genes cromosómicos
Células F+
Células que poseen el plásmido F no integrado
Células Hfr
Plasmido integrado en el cromosomas.
Conjugación lleva a la transferencia de genes del cromosoma del hospedador. (Cromosoma + plásmido son uno mismo, uhoh).
Que provoca la presencia del plásmido F
Sintetizan pilis
Movilizan ADN para transferencia a otra célula
Alteración en los receptores superficailes, la célula deja de ser receptor en conjugación.
Que es la complementación
Gen silvestre complementa una mutación defectiva, corrigiendo el problema
Trasposones
Son secuencias de ADN que pueden moverse de manera autosuficiente a diferentes partes del genoma de la célula.
Aparecen en cromosoma principal y plásmidos bacterianos.
Se transponen entre cromosoma y plásmido
Presentes en euca y proca
Siempre integrados (qué envidia)
No presentan homología con la secuencia donde se van a integrar, causando mutaciones.
Transposones tipo 1 simples
700-2000 pb
Contiene gen TnpA que codifica la transposasa
Flanqueado por dos secuencias invertidas repetidas cortas (15-25 pb)
Transposones tipo 1 compuestos
Un gen (usualmente resistencia a antibiótico) está flanqueado por dos sec. de inserción.
Transposones tipo 2
Contiene al menos 3 genes
TnpA (transposasa)
TnpR (resolvasa)
Gen que da resistencia a antibioticos
Flanqueado por secuencias repetitivas invertidas
Transposones tipo 3
Fagos que, en lugar de insertarse en el genoma por recombinación, lo hacen por transposición
Secuencias de inserción
Segmentos de ADN bacteriano que pueden moverse de posición en el mismo cromosoma o distinto. Cuando aparecen en medio de los genes, interrumplen la secuencia de codificación e inactivan expresión del gen
Estructura S.I.
Repeticiones invertidas en los extremos-Región codificante central: Transposasa.
Extremos flanqueads por cortas repeticiones directas (5-11 pb)
Secuencia variable en sitio de inserción
Características S.I.
>20 tipos distintos
mov. poco frecuente
pueden inactivar genes
Pueden transferirse a otras bacterias mediante transposición a plásmidos o virus
Mecanismo Transposones
Corta el elemento (extremo romo)
Corta el ADN en sitio de integración (extremo protuberantes)
Liga el elemento en el nuevo sitio (3' del SI al 5' del ADN aceptor)
Rellena y cierra Nick: ADN polimerasa y ligasa de bacteria
Transposasa
Proteína específica que introduce el transposón a una secuencia.
Diferencia transposones con recombinación
no requiere homología entre secuencia donadora y aceptora
Donde fueron descubiertas las SI
E. coli en operador gal
Transposones más simples (700-1500 pb en eubacterias y arqueobacterias)
Frecuentes en bacteriófagos y plásmidos