Diversidad genética	Variabilidad genética presente en una población o especie, variedad de diferentes genes
Estructura genética	La manera en cómo está repartida esa diversidad genética en todos los niveles
Estructura de las poblaciones	Estructura demográfica y estructura genética
Estructura demográfica	Determinada por procesos de nacimiento, muerte dispersión de los organismos, sistema de apareamiento historia de vida Estudiada por censos y observaciones
Estructura genética	Determinada por la estructura demográfica y tamb por procesos genéticos como la mutación, recombinación, selección, deriva génica y flujo genético De evalúa los genotipos Se debe conocer las frecuencias alélicas
Distancia genética	Proporción de elementos genéticos que no son compartidos por dos muestras Para calcular se debe conocer la identidad o similitud genética
Similitud	Marcadores dominantes
Distancia	Marcadores codominantes
Modelo de mutación de alelos infinitos isoenzimas	Cada mutación da origen a un alelo Si dos genes son iguales no hay mutación
Modelo de mutación gradual microsatélites	La mutación modifica el número de repeticiones aumentando o disminuyendo paso a paso
Modelo de mutación de la secuencia del nucleótido	Mutación sencilla es la mutación de una base única
Cómo se evalúa estructura genética	Estadísticos F Fis= uno menos Hi/Ht Fit= uno mes Hi/Hs Fst= unos menos Hs/Ht
Interpretación de Fst	0= no existe divergencia genética 1= fijación para alelos alternos 0 a 0.05 pequeña 0.05 a 0.15 moderada 0.15 a 0.25 grande Mayor a 0.25 muy grande
Estimadores análogos a Fst	GST múltiples alelos Rst muestras grandes mayores a 50 y muchos loci mayor a 20 Fst tamaño de muestra 10 loci 20
Amova	Estudia la variación molecular dentro de una especie Modelo jerárquico o anidado Diferenciación genética que no necesita la suposición de EHW puede usarse en marcadores dominantes
Relaciones genéticas análisis de agrupamiento	formar grupos tal que los elementos de un grupo sean más parecidos entre sí que con los elementos de otro grupo Es necesario seleccionar una medida de distancia o similitud y un criterio de método de agrupamiento Neighbor joining sistemas viejos Método upgma sistemas recientes plantas domesticadas
Bootstrapping:	Es un método de remuestreo con reemplazo con la misma matriz de datos
Relaciones genética métodos de ordenación	Las unidades de observación se presentan como puntos en el espacio de dos o más dimensiones que surgieron de una combinación de las originales PcoA utiliza variables cualitativas y una distancia relacionada con la similaridad entre los individuos
Métodos para la ordenación de datos de marcadores moleculares	PCoA Escalamiento multimensional no métrico NMDS Análisis de correspondencia CA
Pruebas de asignación de individuos	Permiten estimar la probabilidad de que un individuo pertenezca a un grupo o población
Pruebas de mantel	Correlación entre distancia genética y distancia geográfica SI HAY UNA DIFERENCIACIÓN genética es consecuencias de su aislamiento geográfico IBD Correlación positiva y significativa existe una estructura espacial que puede relacionarse a la distancia geográfica Relacionada con el flujo genético
Fuerzas o factores generan o restringen la diferenciación genética	Flujo genético Deriva genética Selección
Nm	Número. De inmigrantes por generación
Deriva genética	Una consecuencia de esta es la diferenciación genética
Factores que influyen en el flujo genético	Biología y ecología repeoductiva
Mecanismos de dispersión	Anemocoria Anemohidrocoria Hidrocoria Zoocoria Autocoria Antropocoria
Barreras reproductivas	Barreras precigoticas: aislamiento, aislamiento del comportamiento, aislamiento temporal, ailsmaniento mecánico, aislamiento gametico Barreras posrcigoticas: viabilidad híbrida reducida
Fragmentación del hábitat y metapoblaciones	Fragmentación en un bosque, perdida del hábitat, limitación de dispersión, efectos de borde,
Efectos en procesos ecológicos	Efecto Allee
Medición del flujo génico métodos directos	Observar la distribución espacial de los alelos en las poblaciones para hacer inferencias de los niveles de patrones
Medición del flujo genético modelo demográfico	Modelo continente isla Modelo de islas infinitas Modelos de stepping stone Modelo de aislamiento por distancia Modelos metapoblacionales
Medición del flujo genético parámetro estimador	Fst mide la variación de las frecuencias alélicas entre poblaciones y por lo tanto la diferenciación genética entre ellas Alelos privados

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