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¿Qué es la evolución biológica?
Es el conjunto de transformaciones o cambios a través del tiempo que ha originado la diversidad de formas de vida que existen sobre la Tierra a partir de un antepasado común
¿Cuáles son los mecanismos de evolución?
Selección natural
Deriva génica
¿Qué es la selección natural?
Proceso por el cual cambios genéticos que mejoran la capacidad reproductiva se vuelven más frecuentes y permanecen sucesivas generaciones de población
¿Qué es fitness o aptitud biológica?
Medida de la contribución genética de un organismo a la generación siguiente
¿Qué es un Alelo?
Cada una de las formas alternativas que puede tener un mismo gen, se diferencian en su secuencia y esto puede manifestarse en modificaciones concretas en su función
¿Qué es frecuencia alélica?
La proporción que se observa de un alelo específico respecto al conjunto de los que pueden ocupar un locus determinado de población
¿Qué es la deriva génica?
Es el cambio en la frecuencia de los alelos provocado por muestreo aleatorio de los genes de una generación a la siguiente.
Actúa más rápido que la selección natural
¿A qué se le conoce como cuello de botella'
A la disminución drástica del tamaño poblacional que se presenta en una sola generación
¿Quién realizó el experimento de las primeras biomolecular, recreando las condiciones prebióticas de la tierra y usando gases?
Miller-Urey
¿Qué polímeros pueden dirigir su propia síntesis?
Los polinucleótidos
¿A qué se le conoce como código no ambiguo?
Cada triplete de nucleótidos que codifica para un aminoácido específico
¿A qué se le conoce como código degenerado?
Hay más de un triplete que codifica para un determinado aminoácido
¿Cómo es el código genético eucariote?
Es degenerado
Hay más de un triplete que codifica para un determinado aminoácido
¿A qué se le conoce como biología sintética?
Se define como la síntesis de biomoléculas o ingeniería de sistemas biológicos con funciones nuevas que no se encuentran en la naturaleza
¿Cuáles son los péptidos con actividad catalítica?
Ser-His
Ser-His-Gly
¿Cuál es la bacteria con el genoma más pequeño conocido?
Mycoplasma genitalium
0.8 Mb
¿Qué es un Serotipo?
Microorganismo infeccioso clasificado según las antigénicas que presenta
¿Qué es una cepa?
Población celular de una especie que desciende de una única célula, usualmente propagada clonalmente
¿Para qué sirve la hibridación genómica comparada?
Técnica de citogenética molecular que permite identificar ganancias y pérdidas del genoma tumoral mediante la hibridación competitiva de ADN normal y tumoral frente a cromosomas normales
¿Cómo se encuentran el DNA en las células procariontes?
Disperso por todo el citosol
¿De cuánto es el ancho de la membrana citoplasmática en procariontes?
6 a 8 nm de ancho
Funciona como: barrera permeable, sitio de anclaje de proteínas y conservación de la energía
¿Qué es tactisismo?
Respuesta a un gradiente de agentes físicos o químicos dirigiendo el movimiento hacia el estímulo o en sentido contrario
¿Qué es la quimiotaxis?
Es la respuesta a agentes químicos
En el movimiento celular como respuesta sensorial ¿Que ocurre en ausencia de gradiente?
La célula avanza en carrera con movimiento del flagelo en sentido contrario a las manecillas del reloj
En el movimiento celular como respuesta sensorial ¿Que ocurre en presencia de atrayente?
Las carreras son cada vez más frecuentes conforme se incrementa la concentración de atrayente, los tumbos disminuyen en frecuencia
¿Cuál es el nombre de la proteína transmembrana localizada en la membrana de los procariontes, para la regulación de quimiotaxis?
Proteínas quimiotáctica aceptora de metilo (MCP)
- Esta en contacto con CheW y CheA
¿Qué tipo de molécula es la regulado la dirección de la rotación del flagelo?
CheY
- Repelentes aumenta el nivel de CheY-P, natación a tumbos
- Atrayentes disminuyen el nivel de CheY-P, natación suave
¿Qué molécula desfosforila a CheY- P?
CheZ
¿Qué moléculas metilan a MCP y cuál lo desfosforila?
CheR - Metila a MCP
CheB-P - Desmetila a MCP
¿Cuáles son las etapas de la quimiotaxis?
Respuesta a la señal, control de la rotación flagelar y adaptación
¿Qué es la lámina nuclear?
Una red entrecruzada de filamento intermedios (15 a 80 nm de grosor) compuestos por proteínas láminas A, B y C.
Está en la periferia del nucleoplasma
¿Qué funciones lleva a cabo el núcleo?
Almacenamiento de casi todo el ADN
Transmisión de información genética para la división celular
Transporte de sustancias
Producción de ribosomas en el núcleolo
Replicación y transcripción
¿Cuál es la función del núcleolo?
Síntesis del RNA ribosómico (18S, 28S, 5.8S) y ensamble de ribosomas
¿El rRNA 5S es transcrito por qué RNA pol?
Por la tipo III
¿Quién transcribe al precursor 45S, el cual corta los rRNAs?
Por la RNA pol I
¿Cuál es el complejo de importación y cuál el de exportación?
- importación, dimérico, NTR- importina
- Exportación, trimérico, NTR-exportina + Ran GTP
¿Cuáles son las mitorribosomas animales?
55S. rRNAs 12S y 16S
¿Qué es un virus?
Partícula formada por ácido nucleico (RNA o DNA) en el interior de una cubierta proteica
Paracito intracelular obligado, Metabolismo dependiente de un huesped
¿Qué significa tropismo?
Capacidad de un virus para infectar o dañar un tipo de células, tejidos o especies de organismo específicos
¿Qué es virulencia?
Capacidad de un virus de crecer, ser invasivo, infectar células vulnerables, evadir el sistema inmune, altera procesos celulares y causar daño tisular
¿Qué es una célula permisiva?
Célula que puede soportar el ciclo de vida completo del virus. Soporta la infección productiva
¿Cuáles son los tipos básicos de infección viral?
Lítica, utiliza a la célula como maquinar
Lisogénica (integrativa), DNA viral con el genoma celular (provirus)
Todos los virus están compuesto por un ácido nucleico rodeado de una cápside proteica ¿Se llama?
Nucleocápside
¿Qué es un protomero?
Subunidad proteica que se asocia en una estequiometría definida para formar la cápside viral
¿Cuál es la forma de las cápsides virales?
Icosaédrica (20 lados)
- Capsómeros, Unidad formada por 5 o 6 protómeros
Helicoidal
- Nucleocápsides filamentosas tubulares
Características de la tasa de mutación viral
- Ventaja selectiva en su viabilidad biológica
- Menor en virus de DNA, ya que sus enzimas son más precisas y realizan procesos de correción
- Todos los virus de RNA codifican su propias polimerasas
¿Qué son las cuasiespecies virales?
Mezcla de virus relacionados presentes en un hospedero en un momento determinado.
Se comportan casi como si fueran un solo tipo de especie
¿Cuáles son los procesos físicos de titulación de virus?
- Microscopía electrónica
- Hemaglutinación
- qPCR
- Medición de la densidad óptica. Espectrofotometría
¿Cuáles son los procesos biológicos para la titulación de virus?
Método de punto final
Concentración de unidades infecciosas
- PFU
- Ensayo de enfoque
¿Qué significa el MOI (multiplicidad de la infección?
Cantidad promedio de virus que se adiciona por cada célula en una infección
¿Cuáles son los virus de clase I, que poseen hélices alfa?
Influenza, VIH, ebola y SARS-COV-
¿Cuáles son los virus de clase II, que poseen barriles beta?
Flavivirus, alfavirus y bunyavirus
¿Cuáles son los virus de clase III, que poseen proteínas G con dos asas hidrofóbicas?
Virus de la estomatitis VSG-G, rhabdovirus, herpes virus
Físico danés que ganó el premio nobel de física en 1922
Niels Bohr
Médico y genetista británico, que estableció el principio de transformación en 1928
Frederick Griffith
¿Cómo está formado un nucleósido?
Base nitrogenada + azúcar
¿Cómo está formado un nucleótido?
Base nitrogenada + azúcar + fosfato
¿Cuál es el principal nucleótido existente en las células?
ATP
Transporta energía en sus enlaces anhídrido de ácido
¿En dónde se lleva a cabo la polimerización?
En el extremo 3' a partir de dNTPs
¿Cuál es la conformación más común que adopta el ADN?
Doble hélice dextrógira
¿Cuál es la secuencia que produce una curvatura moderada en el DNA?
Cuatro adeninas seguidas (AAAANNN)
Seis adeninas, curvan el ADN 18 grados
¿A qué se le conoce como región palindrómica?
Secuencias de ácidos nucleicos bicatenarios con simetría doble
¿A qué se le conoce como región repetida en espejo?
Secuencia simétrica dentro de cada cadena
¿Qué es un mRNA monocistrónico?
Tiene un solo sitio de inicio de la traducción y codifica para un único polipéptido
¿Qué es un mRNA policistrónicos?
Codifica para dos o más polipéptidos
Proteína de unión al poli A, se une cada 10-20 bases
PABP
Características del tRNA
Contiene el anticodón complementario al codón que representa su aminoácido
Forma de hoja de trébol
Adenina en el extremo 3'
¿Qué es la cromatina eucariota?
Sustancia que forma un cromosoma y consiste en la combinación de ADN con proteínas (histonas)
¿Qué es la eucromatina?
Forma activa de la cromatina
¿Qué es la heterocromatina?
Compacta durante la interfase
Sin actividad transcripcional
¿Cuál es la heterocromatina constitutiva?
Regiones densamente empaquetada permanentemente
De forma típica en los centrómeros
¿Qué es la heterocromatina facultativa?
Cromosomas enteros que son inactivos
¿Qué son las cromátidas hermanas?
Son los cromosomas resultantes del evento replicativo previo, que todavía permanecen juntas en ese estadio de mitosis
¿Qué son los cromosomas homólogos?
Son un par de cromosomas (uno de la madre y otro del padre) que tiene la misma disposición de la secuencia de DNA de un extremo a otro, pero puede tener distintos alelos
¿Qué es ploidía?
Número de juegos/conjuntos de cromosomas de una célula u organismo
¿Qué es poliploide?
Especie o individuo cuya dotación cromosómica es múltiplo de X mayor que 2X
¿La formación del lazo en el extremo 3' esta catalizada por?
TRF2 ¿TTAGGG repeat binding factor)
¿Cuál es la subunidad de toda la cromatina?
El nucleosoma
Características del nucleosoma
-200pb de DNA organizado como octámero (+H1) en formas de cuentas de collar
El punto de entrada y salida esta ocupado por la H1
¿Cómo es la replicación conservativa?
Las cadenas originales se mantiene unidas después de servir como molde, al igual que las sintetizadas de novo
¿Cómo es la replicación dispersiva?
La molécula de DNA original se fragmenta, replicándose cada fragmento en pequeños pedazos y a partir de ellos se sintetizan las cadenas de novo, de tal forma que los duples hijos tendrían cadenas de DNA antiguos y nuevos?
Isotopos utilizados por Meselson-Stahl para marcar la replicación
N15 - Isotopo pesado
N14- Isótopo normal "ligero"
¿Qué es un replicón?
Unidad del DNA (genoma) en la que se produce un acto individual de replicación
Se dispara una sola vez en cada ciclo celular
¿Qué es la horquilla de replicación?
Punto en el que se esta produciendo la replicación
¿Cuáles son las fases de la replicación?
Iniciación, elongación, terminación
¿Cuáles son las DNA polimerasas que participan en la reparación del DNA?
I y II
¿Únic DNA polimerasa con actividad replicasa?
III
¿Qué es el proofreading?
Actividad correctora 3'-5' exonucleasa
¿Cómo es la síntesis del DNA?
Semidiscontinua
¿Qué enzima incorpora un cebador de RNA (11-12 pb)?
Primasa
¿Cuál es la única polimerasa con actividad 5'-3' exonucleasa?
DNA pol I
Durante la replicación remueve los cebadores de RNA
¿Actividad de la DNA ligasa?
Sella la melladura (nick)
Enzima encargada de separar las cadenas de DNA, empleando hidrólisis de ATP
Helicasa
Proteína de unión a la cadena sencilla de DNA
SSB
¿Cuales son los componentes de la holoenzima replicasa?
alfa, epsilon, theta, beta, gama, tau
Componentes de la holoenzima replicasa que conforma el núcleo
alfa, beta y theta
¿Cuál es el componente de procesividad que mantiene a la polimerasa sobre el DNA?
Dímero beta. Tenaza o abrazadera
¿Cuál es el componente que conecta al complejo helicasa-primasa con la polimerasa?
Tau
¿Cuáles son los elementos de la terminación de la replicación?
Elementos ter, que son reconocidos por el gen tus
¿Cuál es el efecto que produce la metilación del origen de replicación OriC?
Asegura que solo se utilice una vez en cada ciclo
11 copias de la secuencia GATC en el origen
Dam metila la adenina en N6
¿Qué es la burbuja de transcripción?
Lugar de síntesis de RNA (-40nt/s) que se mantiene dentro de la RNA polimerasa que desenrolla el DNA (12-20pb)
¿Qué es la unidad de transcripción?
Fragmento de DNA que se expresa mediante la producción de una molécula de RNA y que comprende desde el promotor hasta el terminador
¿Cuál es la principal función del promotor?
Permitir la unión de la RNA polimerasa al inicio del gen
¿Qué estructura rodea el sitio de iniciación?
El promotor
¿Qué es el transcrito primario?
Es el producto inmediato de la transcripción
Extremos 5' y 3' orginales
¿Cuáles son las etapas de la transcripción?
Reconocimiento del molde, iniciación, elongación, terminación
Subunidad de la RNA polimerasa de eubacterias que le permite reconocer promotores con diferentes secuencias consenso
Sigma
¿Qué es una secuencia consenso?
Secuencia ideal constituida por las bases que aparecen con más frecuencia en una posición determinada
Características de la secuencia consenso -10
Procariontes- proporciona la señal para el reconocimiento de la RNA pol
Eucariontes- necesaria para que los factores basales de la transcripción recluten a la RNA polimerasa, se una y complete la fase de iniciación
Características de la secuencia consenso -35
Permite la conversión de la forma cerrada a abierta (duplex DNA desnaturaliza) del complejo
¿Dónde se encuentran la mayoría de los sitios de unión de la enzima RNA polimerasa?
Corriente arriba de -10 en la misma cara de la cadena no molde (codificante)
¿Cuál es el proceso responsable del superenrollamiento del DNA?
La transcripción
¿Cuáles son los terminadores intrínsecos de la transcripción?
- Formación de un tallo burbuja en el RNA transcrito
- Si el número de bases entre la región G-C y poli U es mayor de 9, la RNA polimerasa hace una pausa pero no termina la transcripción
¿Cuál es la función de Rho en la terminación de la transcripción
Rho tiene actividad ATPasa ARN dependiente y actividad helicasa que separa RNA-DNA
Interacciona con la subunidad beta de la RNA polimerasa
Modelo del objetivo caliente
¿Qué transcribe la RNA polimerasa I?
rRNAs (28S,5.8S,18S). Nucléolo
¿Qué transcribe la RNA polimerasa II?
mRNA, miRNA, snRNA, otros. Nucleoplasma
¿Qué transcribe la RNA polimerasa III?
tRNA, rRNA 5s, sn RNA, nucleoplasma
¿Qué es un factor de transcripción
Proteína que se necesita para el reconocimiento del molde y la iniciación de la transcripción, pero que no es en sí parte de la RNA polimerasa
¿Cuáles son los promotores de la RNA polimerasa I?
Secuencia bipartita, Hacia el del sitio de iniciación 5' Core y UCE.
Factores de transcripción UBF1 y SL1
¿Cuáles son los promotores de la RNA polimerasa II?
Tipo I y II. Hacia el 3' del sitio de iniciación
Tipo III. Hacia el 5' del sitio de iniciación
Factores de transcripción. TFIIIA, TFIIIB, TFIIIC
Lleva a cabo el reconocimiento inicial del promotor
TFIID
¿Qué hace el TBP?
Se une al DNA en el surco menor
Único TFII que contacta una secuencia específica del DNA
Curva el DNA unos 80 grados en la TATA box ampliando el surco menor
¿Cuáles son las dos subunidades de TFIIF?
- RAP74, helicasa ATP dependiente
- RAP38, une a la RNA polimerasa II
¿Cuál es la enzima que fosforila el CTD de la RNA polimerasa II?
TFIIH
¿Cuáles son los genes adaptativos?
Genes que codifican sistemas enzimáticos necesarios para determinadas situaciones, se expresan diferencialmente cuando la célula se adapta a determinada situación ambiental
¿Qué es el splicing?
Proceso que elimina los intrones
¿Cuáles son las regiones conservadas para el splicing ?
GT-AG
¿Qué actividades comprende el splicing del tRNA?
Nucleasa y ligasa
¿RNA que tiene un apareamiento de bases con el sitio de empalme 5'?
snRNA U1
¿Cuáles son las fases de las síntesis de proteínas?
Iniciación, elongación, terminación
¿Dónde se encuentra el factor de iniciación para la traducción?
En la subunidad 30S
Participa en la formación del complejo terniario
elF2, que se asocia a la subunidad 40S
¿Cuál es el factor de elongación en eucariotes?
EF-Tu
Enzima encargada de formar el enlace peptídico
Peptidil transferasa
¿Cuál es el factor que se une al ribosoma para favorecer la translocación?
EF-G
¿Qué es el Marco abierto de lectura (ORF)?
Secuencia de RNA comprendida entre un codón de iniciación y uno de terminación de la traducción, sin contar los posibles intrones, flanqueado por los UTRs (regiones no traducidas)